La description:
L'Institut Jean-Pierre Bourgin - Sciences du Végétal (IJPB) est une très grande unité mixte de recherche (UMR 1318), regroupant un ensemble unique en France de ressources et de compétences pluridisciplinaires en biologie, chimie et mathématiques appliquées. Dans le cadre du projet InterCarnot Plant2Pro/3BCAR RAMBO, Les équipes Acquisition d'Azote dans les Systèmes Symbiotiques Plantes-Microbes (SYNAPS), Observatoire du Végétal-Chimie Métabolisme (OV-Chimie) et Glycanes et Signalisation (GAS) recrutent un(e) Ingénieur(e) pour 25 mois qui exercera ses missions au sein de l'IJPB, INRAE de Versailles. Votre mission RAMBO est un projet collaboratif, fédérant l'IJPB et le laboratoire Biodiversité et Biotechnologie Fongique (BBF, Marseille). L'objectif du projet est de déterminer comment maximiser la production microbiologique de molécules bioactives à partir de paillage de Miscanthus, afin de renforcer la résilience des plantes d'importance agricole (ici le maïs - Zea mays). La personne recrutée aura pour objectif de : - Caractériser les biomasses (Composition en monosaccharides, teneur en N et C) avant et après dégradation fongique - Analyser les métabolites, oligosaccharides et peptides produits par les champignons au cours de la dégradation du miscanthus - Caractériser les oligosaccharides produits lors de l'infection du maïs par un champignon phytopathogène (Ustilago maydis) et les comparer à ceux produits lors de la dégradation du miscanthus. Elle contribuera également à : - Analyser le microbiome du paillage de Miscanthus avant et au cours de la dégradation par un champignon (metabarcoding) - Isoler et identifier des bactéries fixatrices d'azote qui agissent en synergie avec les champignons lors de la dégradation de la biomasse - Analyser l'amélioration des défenses du maïs contre le pathogène modèle Ustilago maydis après infiltration foliaire des extraits de bioconversion - Analyser les propriétés de biostimulation et de biocontrôle après application du purin de bioconversion au pied de la plante - Analyser l'effet des produits de bioconversion sur les bactéries bénéfiques du maïs. Profil idéal : Il/elle devra rassembler la majeure partie des caractéristiques suivantes : - une solide formation et une expertise avancée en spectrométrie de masse et en analyse de données de métabolomique (LC-MS, GC-MS) - une bonne formation en physiologie végétale - un intérêt pour les analyses de communautés microbiennes (Metabarcoding et analyse FROGS sur Galaxy) - une expérience pratique en cultures microbiennes et caractérisation - une aisance dans la rédaction scientifique et la présentation de résultats (conférences,revues) - d'excellentes qualités relationnelles pour collaborer avec des partenaires internes/externes - un esprit d'équipe et une forte capacité d'adaptation - une rigueur méthodologique, un esprit proactif et d'initiative - la connaissance des protocoles HSE en laboratoire - un très bon niveau d'anglais (B2 minimum) Votre qualité de vie à INRAE En rejoignant INRAE, vous pourrez bénéficier selon le type de contrat : - jusqu'à 30 jours de congés + 15 RTT par an (pour un temps plein) - d'un soutien à la parentalité : CESU garde d'enfants, prestations pour les loisirs ; - de dispositifs de développement des compétences : formation, conseil en orientation professionnelle ; - d'un accompagnement social : conseil et écoute, aides et prêts sociaux ; - de prestations vacances et loisirs : chèque-vacances, hébergements à tarif préférentiel ; - d'activités sportives et culturelles et d'une restauration collective.